정량분석
qPCR 효율 계산기
qPCR Efficiency Calculator
표준곡선의 농도·Ct 점으로 증폭 효율 E = 10^(-1/slope) − 1과 R²를 계산하고 pass·caution·unfit 밴드로 판정합니다. 두 축 방향을 자동 변환하며 결과를 Pfaffl 효율 보정에 바로 사용할 수 있습니다. 서버 전송 없이 브라우저에서만 계산합니다.
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Ct 데이터 붙여넣기
— 연구용(RUO) · 브라우저에서만 계산 · 서버 전송 없음
소개
qPCR 효율 계산기는 표준곡선(standard curve)의 농도·Ct 점을 입력하면 선형 회귀로 기울기(slope)와 R²를 구하고, 증폭 효율 E = 10^(-1/slope) − 1과 효율(%)을 계산합니다. 결과는 pass(90–110% 및 R²≥0.98)·caution·unfit 밴드로 판정하며, 표준곡선의 축 방향(x=log10 농도·y=Ct 또는 그 반대)을 자동으로 canonical 정의로 변환해 어느 export 레이아웃에서도 동일한 효율을 냅니다. 계산한 효율은 Pfaffl 효율 보정과 ΔΔCt 해석에 바로 사용할 수 있습니다. 모든 계산은 브라우저에서만 수행되며 서버로 전송되지 않습니다.
E = 10^(−1/slope) − 1 · E_factor = 10^(−1/slope) · efficiency(%) = E × 100canonical 축은 x=log10(quantity), y=Ct입니다. 효율(%)과 amplification factor는 E_factor = 1 + %/100로 변환됩니다(100% = 2.0). 표준곡선 점은 3개 이상이어야 하며 기울기가 음수여야 계산됩니다.
예시
- 이상적인 100% 효율·농도 1·10·100·1000, slope −3.32 (=−log₂10), R² 1.0 → E 100.0% · band pass
- 낮은 효율(caution)·slope ≈ −3.75 (E_factor 1.85) → E 85% · band caution (80–90%)
- 축 방향 자동 변환·x=Ct, y=log10(농도) 레이아웃 → 내부에서 canonical로 변환해 동일한 E 산출
자주 묻는 질문
- 정상적인 qPCR 효율(%)은 어느 범위인가요?
- 일반적으로 90–110%(그리고 R² ≥ 0.98)를 pass로 봅니다. 80–90% 또는 110–120%는 caution, 80% 미만이나 120% 초과는 unfit입니다. 효율이 범위를 벗어나면 R²와 무관하게 unfit으로 판정합니다.
- 기울기(slope)에서 효율은 어떻게 나오나요?
- E = 10^(−1/slope) − 1 입니다. 완전한 2배 증폭(100% 효율)은 slope가 −3.32(=−log₂10)에 해당하며, 표준곡선 점이 3개 미만이거나 기울기가 음수가 아니면 계산이 차단됩니다.
- 표준곡선의 축 방향이 다르면 결과가 달라지나요?
- 아니요. x=log10(농도)·y=Ct와 x=Ct·y=log10(농도) 두 레이아웃을 모두 지원하며, 내부에서 canonical 정의로 변환해 동일한 효율을 산출합니다(완전한 곡선에서 두 방향의 E가 일치).
- 효율 %와 amplification factor(2.0)의 차이는?
- Pfaffl 계산은 amplification factor(2.0 = 100%)를 사용하고 사람은 %로 생각합니다. 변환은 E_factor = 1 + %/100 한 곳에서만 일어나며, 내부 계산은 모두 factor로 수행됩니다.
- 플레이트 간 표준곡선을 합칠 수 있나요?
- 현재 버전은 하나의 표준곡선 단위로 효율을 계산합니다. 서로 다른 런(run)을 자동으로 보정하는 inter-run calibrator는 포함하지 않으므로, 공통 calibrator 없이 여러 플레이트를 합칠 때는 비교 타당성에 주의하세요.