서열 분석
ORF 찾기
ORF Finder
양쪽 가닥에서 열린 해독틀(ORF)을 찾아 원본 서열 좌표로 표시합니다. 역가닥 ORF도 원본 좌표로 변환하며 시작코돈 모드·최소 길이를 조절할 수 있습니다.
타입
이 서열은 저장되지 않아요. 모든 계산은 브라우저에서 실행되며 서버로 전송되지 않습니다.
같은 서열로 이어서 분석
서열을 붙여넣으면 ORF 표가 표시돼요.
소개
ORF 찾기는 서열의 양쪽 가닥에서 열린 해독틀(open reading frame)을 탐색해 ID·가닥·프레임·시작–끝 좌표·길이(nt/aa)·시작/정지코돈·단백질 미리보기를 표로 보여줍니다. 핵심은 좌표 정확성입니다. 역가닥 ORF는 reverse complement에서 찾지만 좌표는 항상 원본 서열의 1-기반 5'→3'(start≤end)로 변환해 보고하므로, 프라이머를 잘못된 위치에 설계하는 실수를 막습니다. 시작코돈 모드와 최소 길이를 조절할 수 있고 계산은 브라우저에서만 수행됩니다.
start codon … in-frame stop · reverse-strand → original 5'→3' coordinates역가닥 좌표 = L − (working position) + 1. 최소 길이 미만 ORF는 숨기지 않고 표시(dim)합니다.
예시
- 정방향·ATGAAATAA → ORF +가닥 1–9, ATG…TAA, 단백질 MK
- 역가닥 좌표·GGTTATTTCAT → −가닥 ORF가 원본 좌표 3–11로 보고
- 세균 대체시작·GTGAAATAA (code 11, alt starts) → GTG 시작 ORF 인식
자주 묻는 질문
- 역가닥 ORF의 좌표는 어느 기준인가요?
- 항상 원본 서열의 정방향(5'→3') 좌표로 start≤end로 보고하며, 가닥은 +/− 배지로 표시합니다. 실제 5' 시작 위치는 별도 필드로 제공합니다.
- ORF가 하나도 안 나와요.
- 짧은 서열이거나 시작코돈 모드/최소 길이 때문일 수 있습니다. 최소 길이 미만 ORF는 개수와 함께 '보기'로 펼칠 수 있습니다.
- GTG·TTG 시작코돈도 찾나요?
- 시작코돈 모드를 '대체 시작코돈'으로 두고 세균(#11) 등 해당 유전코드를 선택하면 GTG/TTG 시작 ORF를 인식합니다.