서열 분석
역번역 (단백질→DNA)
Reverse Translation
단백질 서열을 발주 가능한 consensus DNA와 degenerate(IUPAC) DNA로 역번역하고, 잔기별 축퇴도와 이론상 서열 수를 함께 보여줍니다.
타입
이 서열은 저장되지 않아요. 모든 계산은 브라우저에서 실행되며 서버로 전송되지 않습니다.
같은 서열로 이어서 분석
소개
역번역(reverse translation)은 단백질 서열을 그것을 코딩할 수 있는 DNA로 되돌리는 과정입니다. 유전코드는 축퇴적이라 한 아미노산에 여러 코돈이 대응하므로 결과는 본질적으로 모호합니다. 이 도구는 발주 가능한 단일 consensus DNA를 우선 산출물로 제시하고, 모든 가능성을 담은 degenerate(IUPAC) DNA는 라이브러리·프라이머 설계용 아티팩트로 구분해 보여줍니다. 잔기별 축퇴도와 이론상 가능한 서열 수(BigInt)도 함께 제공하며, 계산은 브라우저에서만 수행됩니다.
amino acid → synonymous codons → consensus(단일) + degenerate(IUPAC)totalDegeneracy = 잔기별 축퇴도의 곱. Leu·Ser·Arg는 축퇴도가 높습니다. host codon-usage(CAI)는 미적용.
예시
- 단순·M → consensus/degenerate ATG (축퇴 1)
- 고축퇴 잔기·L (Leu) → degenerate YTN (fold 8)
- 발주용 서열·MKV → 단일 consensus DNA + degenerate 병기
자주 묻는 질문
- consensus와 degenerate 중 어느 것을 주문하나요?
- 합성 벤더에는 단일 서열인 consensus DNA를 주문합니다. degenerate(IUPAC)는 여러 서열을 포함하는 라이브러리/프라이머 풀 표현이라 단일 유전자 합성에는 쓰지 않습니다.
- '이론상 가능한 서열 수'는 무엇인가요?
- degenerate 서열이 나타내는 서로 다른 DNA 서열의 총수로, 잔기별 축퇴도의 곱입니다. 유전자 길이에서는 매우 커져 과학적 표기로 보여줍니다.
- 발현 숙주에 맞춘 코돈 최적화도 되나요?
- 현재는 host codon-usage(CAI)를 적용하지 않는 기본 역번역입니다. 숙주별 코돈 최적화는 준비 중이며 별도 도구로 제공될 예정입니다.